Bioinformatiikan maisteri laskennallisesta genomiikasta
Politecnico di Milano
Keskeiset tiedot
Kampuksen sijainti
Milan, Italia
Kieli (kielet
Englanti
Opintomuoto
Kampuksella
Kesto
2 vuotta
Vauhti
Täysaikainen
Lukukausimaksut
EUR 3 898 / per year *
Hakemuksen määräaika
Pyydä tietoja
Aikaisin aloituspäivä
Sep 2024
* ETA-alueen ulkopuolisten opiskelijoiden lukukausimaksut vastaavat automaattisesti 3898,20 euron kokonaismaksua; ETA-opiskelijoiden lukukausimaksut vaihtelevat noin 895,20 eurosta 3898,20 euroon vuodessa
Johdanto
Maisterin tutkinto ("Laurea Magistrale") "Bioinformatiikka laskennallisissa genomisissa " on Milano-yliopiston ja Politecnico di Milano yhteinen aloite, ja se käynnistetään alkaen lukuvuodesta 2019-2020.
Kaiken kaikkiaan sen tavoitteena on muodostaa "genomidatan tutkijoita" , toisin sanoen tutkinnon suorittaneita, joilla on riittävät tiedot biologisten järjestelmien molekyylipohjasta; biologisten molekyylien rakenne ja toiminta ja miten ne osallistuvat soluprosesseihin; genomien analysointitekniikat ja -alustat; bioinformatiikan ja genomianalyysin työkalut; sekä tilastolliset ja laskennalliset menetelmät biomolekyylidatan analysoimiseksi.
Pääsy on avoin kaikille opiskelijoille, joilla on kandidaatin tutkinto ("Laurea Triennale") joko biologiassa tai bioteknologiassa tai vastaavissa tietotekniikan, tekniikan, matematiikan tai fysiikan aloilla.
Osallistumalla BCG-tutkintoon opetettuihin kursseihin opit:
- Informaation organisointi genomissa sekä molekyyli- ja soluprosessit geeniekspression ja sen säätelyn pohjalta.
- Geenien ja niiden toiminnan tutkimiseen käytetyt kokeelliset menetelmät eri mallilajeissa, sekä prokaryoottisissa että eukaryoottisissa.
- Nykyaikaisessa genomi- ja epigenomisessa tutkimuksessa käytetyt tekniikat, kuten seuraavan sukupolven sekvensointiin perustuvat määritykset (genomin ja eksomin sekvensointi, RNA-sekvensointi, ChIP-Seq ja niin edelleen).
- Bioinformaattisen analyysin menetelmät ja protokollat funktionaalisessa genomiikkatutkimuksessa (genomin ja eksomin sekvensointi, RNA-sekvensointi, ChIP-Seq ja niin edelleen).
- Bioinformatiikan ja genomianalyysityökalujen taustalla olevat algoritmiset, matemaattiset ja tilastolliset lähestymistavat.
- Tietokantatekniikat tietojen tallentamiseen ja järjestämiseen.
- Systeemibiologiassa käytetyt mallinnus- ja analyysitekniikat vuorovaikutusten tutkimiseen monimutkaisissa biologisissa järjestelmissä.
Ohjelma sisältää perustavanlaatuisen askeleen opiskelijoiden muodostamisessa, harjoittelupaikka tutkimuslaboratorioissa joko Milanon yliopistossa, Politecnicossa tai muissa italialaisissa tai ulkomaisissa tutkimuslaitoksissa. Työharjoittelun kokemus ja sen tulokset kuvataan kirjallisessa väitöskirjassa, josta keskustellaan opinnäytetyövaliokunnan edessä.
Missio ja tavoitteet
Politecnico di Milano ja Università Degli Studi di Milanon yhteinen maisterin tutkinto bioinformatiikan laskennallisesta genomiikasta (BCG) tavoitteena on antaa tutkinnon suorittaneille riittävä tieto biologisten järjestelmien molekyylipohjasta; biologisten molekyylien rakenne ja toiminta ja miten ne osallistuvat soluprosesseihin; genomien analysointiin käytettävät tekniikat ja alustat; bioinformatiikan ja genomianalyysin välineet; sekä tilastolliset ja laskennalliset menetelmät biomolekyylitietojen analysoimiseksi.
Siksi BCG-tutkinto sisältää toimia, jotka antavat perusteellista tietoa:
- Informaation organisointi genomissa sekä molekyyli- ja soluprosessit geeniekspression ja sen säätelyn pohjalta.
- Geenien ja niiden toiminnan tutkimiseen käytetyt kokeelliset menetelmät eri mallilajeissa, sekä prokaryoottisissa että eukaryoottisissa.
- Nykyaikaisessa genomitutkimuksessa käytetyt tekniikat.
- Bioinformaattisen analyysin menetelmät ja protokollat funktionaalisen genomiikan tutkimuksissa.
- Bioinformatiikan ja genomianalyysityökalujen taustalla olevat algoritmiset, matemaattiset ja tilastolliset lähestymistavat.
- Tietokantatekniikat tietojen tallentamiseen ja järjestämiseen.
- Systeemibiologiassa käytetyt mallinnus- ja analyysitekniikat vuorovaikutusten tutkimiseen monimutkaisissa biologisissa järjestelmissä.
Aiheet
Università Degli Studi di Milano tarjoaa kursseja, jotka keskittyvät biologisiin aiheisiin, kun taas Politecnico di Milano tarjoaa laskennallisia kursseja.
1. vuosi
1. lukukausi
- Pakolliset kurssit: Orgaaninen kemia; Bioinformatiikka ja laskennallinen biologia
- Valinnaiset kurssit: genetiikka, solu- ja molekyylibiologia; Biokemia; Ohjelmointi ja tietopohjat; Tilastot
2. lukukausi
- Pakolliset kurssit: genomiikka ja transkriptomiikka; Tieteellinen ohjelmointi; Koneen oppiminen; biostatistics
2. vuosi
1. lukukausi
- Pakolliset kurssit: Advanced Genomics ja Epigenomics; Rakennekemia; Järjestelmäbiologia ja verkkoanalyysi
- Valinnaiset kurssit: Monitieteinen hanke; Genominen Big Data Management ja tietojenkäsittely
Uramahdollisuudet
BCG-maisterin tutkinnon tarkoituksena on kouluttaa "datatieteilijöitä", ammattitaitoisia ammattilaisia, jotka kykenevät yhdistämään syvällisen tiedon biotieteiden molekyylipohjoista ajantasaisella tietämyksellä bioinformatiikan ja genomianalyysin nykyisistä tekniikoista ja tekniikoista. Erityisesti korostetaan myöhempien kvantitatiivisia ja laskennallisia näkökohtia, jotka keskittyvät biologisten järjestelmien analysointiin, mallintamiseen ja ymmärtämiseen. Lopullinen tavoite on kouluttaa monialaisessa ympäristössä ammattilaisia, jotka ovat valmiita selviytymään modernin biomolekyylitieteen genomin jälkeisen aikakauden haasteista ja kykenevät yhdistämään ja integroimaan biologian, genetiikan, tietojenkäsittelytieteen, tietotekniikan ja tilastot perustutkimuksen tai soveltavan tutkimuksen eri aloilla.
BCG: n valmistuneet voivat näin ollen:
- Osallistu laajamittaisten genomianalyysien suunnitteluun ja toteuttamiseen.
- Tunnista ja poimi biologinen merkitys saaduista tuloksista.
- Suunnittelutyökalut ja -protokollat erityyppisten kokeellisten tietojen bioinformatiikan analysointiin itsenäisesti.
- Pelaa keskeisessä roolissa perus- tai sovellettuun genomitutkimukseen keskittyvissä tutkimusryhmissä.
- Koordinoi ja valvoo bioinformatiikkaan ja genomiikkaan liittyviä tutkimushankkeita ja -ryhmiä.
sisäänpääsy
Edellytys päästä BCG-maisteriohjelmaan on kandidaatin tutkinto ("Laurea Triennale"), joka tarjoaa riittävän tiedon joko (1) genetiikasta, molekyylibiologiasta ja biokemiasta tai (2) tietojenkäsittelytieteestä, tietotekniikasta ja matematiikasta. Lisäksi vaaditaan englannin kielen taito, kuten alla on määritelty. Opiskelijat, jotka eivät ole vielä suorittaneet kandidaatin tutkintoa, voivat hakea, jos he aikovat valmistua ennen 31. lokakuuta 2019 (katso alla).
Lukuvuonna 2019-2020 ohjelmaan hyväksytään enintään 50 opiskelijaa , jotka valitaan taustatietojen ja henkilökohtaisen haastattelun perusteella.
Pääsyvaatimukset
Vastaanottovaatimukset italialaisille opiskelijoille
Italialaiset opiskelijat voivat hakea BCG-tutkintoa, jos he täyttävät yhden seuraavista kahdesta vaatimuksesta:
- He ovat suorittaneet kandidaatin tutkinnon (Laurea Triennale) yhdessä seuraavista luokista:
- Biotekniikka (luokka L2)
- Biologia (luokka L13)
- Maatalous ja elintarviketieteet (luokka L26)
- Farmakologiset tieteet (luokka L29)
ja opintojensa aikana he ovat hankkineet vähintään 30 CFU: ta biologisilla alueilla (SSD BIO), jossa on vähintään 18 CFU: ta geneettisesti (BIO / 18), molekyylibiologiaa (BIO / 11) ja biokemiaa (BIO / 10)
TAI
- He ovat suorittaneet kandidaatin tutkinnon (Laurea Triennale) yhdessä seuraavista luokista:
- Tietotekniikka (luokka L8)
- Tietojenkäsittelytiede (luokka L31)
- Fysiikka (luokka L30)
- Matematiikka (luokka L35)
ja opintojensa aikana he ovat hankkineet vähintään 30 CFU: ta tietojenkäsittelytieteen, tietotekniikan, biolääketieteen tekniikan, matematiikan ja / tai tilastojen aloilla (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01 -09 ja / tai SECS-S / 01), joissa on vähintään 6 CFU matematiikassa (MAT / 01-09) ja vähintään 12 CFU yhdessä tai useammassa seuraavista aloista: tietojenkäsittelytiede (INF / 01), informaatio (ING-INF / 05), biolääketieteen tekniikka (ING-INF / 06), tilastot (SECS-S / 01).
Samoja kriteereitä sovelletaan myös sellaisiin ehdokkaisiin, joilla on ulkomaisia korkeakoulututkintoja, joita opettajaneuvosto pitää sopivana, jolloin kullekin kurinalaiselle oppiaineelle on mahdollista tunnistaa selkeästi tieteenalat ja luottojen määrä. Jos tämä ei ole mahdollista, opettajien neuvosto tarkastelee yksityiskohtaisesti ehdokkaiden uraa todistavia asiakirjoja, jotta voidaan arvioida, täyttääkö heidän taustansa aiemmat vaatimukset.
Perustutkinto-opiskelijat voivat hakea, mutta heidän on hankittava kandidaatin tutkinto (Laurea Triennale) ennen 31. lokakuuta 2019.
Ulkomaalaisten opiskelijoiden pääsyvaatimukset
- Opiskelijat, joilla on kandidaatin tutkinto alueella, joka on kuvattu edellisessä kohdassa (Vaatimukset italialaisille opiskelijoille), jossa vaadituilla tieteenaloilla suoritetut kurssit voidaan tunnistaa selvästi yhdessä tuntien / opintopisteiden kanssa. Jos tämä ei ole mahdollista, opettajien neuvosto tutkii opiskelijoiden uran todistavat asiakirjat arvioidakseen, vastaako heidän taustansa aikaisempia vaatimuksia.
Kielivaatimukset
- Opiskelijan on hallittava englantia, hänen on oltava B2-tasoinen. Milanon yliopistoon jo ilmoittautuneet opiskelijat, joilla ei ole B2-todistusta tai vastaavaa, kutsutaan suorittamaan harjoittelutesti todistamaan pätevyytensä ja esittämään siitä haastattelun aikana. Poikkeustapauksissa opiskelijat, joilla ei ole B2-kokeita, voidaan hyväksyä sillä ehdolla, että heidän haastattelun aikana arvioitu englannin kielen taito on selvästi hyvä.
- Italialaista tietoa ei tarvita osallistumiseen. Ulkomaalaisten opiskelijoiden on asetusten mukaan vaadittava kuitenkin, että he ovat saaneet perustiedot italialaisesta kielestä ennen lopullista väitöskirjaa.
Valinta ja sijoitus
Opiskelijat, jotka täyttävät edellä mainitut edellytykset, hyväksytään opetuslautakunnan jäsenten haastatteluun tieteellisten taustatietojen arvioimiseksi.
Ehdokkaiden riittävä henkilökohtainen valmistautuminen (taustalla olevissa aiheissa), kyky kommunikoida englanniksi ja heidän motivaationsa ovat ratkaisevia tekijöitä valinnassa. Haastattelussa arvioidaan ehdokkaan asiantuntemusta kandidaatin tutkintoon liittyvissä aiheissa.
Valiokunta arvioi jokaisen hakijan 100 pisteen asteikolla:
- Hakijalta jatketaan enintään 50/100 pistettä (kurssin tyyppi osallistui, tenttipisteet, jatkokurssit, lisäkoulutukset jne.)
- Haastatteluun myönnetään enintään 50/100 pistettä.
Pääsyyn vaadittava vähimmäispistemäärä on 60/100.
Lukuvuonna 2019-2020 haastattelut italialaisille opiskelijoille ja Italiassa asuville ulkomaalaisille opiskelijoille pidetään biotieteiden laitoksella, Via Celoria 26, 16. heinäkuuta 2019 klo 9.30.
Ulkomaiset hakijat, jotka eivät asu Italiassa ja ovat suorittaneet kandidaatin tutkinnon ulkomailla, voivat valita online-haastattelun. Haastattelun alussa opiskelijoiden on esitettävä voimassa oleva henkilökortti tai passi tunnistamista varten.
Ilmoittautuminen sisäänpääsyn jälkeen
Kun tulokset on julkaistu, ansaintaluokan 50 ensimmäistä sijaa saavien opiskelijoiden on ilmoittautuminen suoritettava kilpailuilmoituksessa asetetussa määräajassa. Myöhemmin, jos alkuperäisen määräajan jälkeen ensimmäiset 50 käytettävissä olevaa paikkaa eivät ole tyydyttyneitä, ilmoittautuminen on mahdollista opiskelijoille, joilla on huonompi ansiosuhde, jos he ovat saavuttaneet vähintään 60/100 valintakokeessa. Perustutkinnon suorittaneiden ilmoittautuminen vahvistetaan vain, jos he suorittavat kandidaatin tutkinnon (Laurea Triennale italialaisille opiskelijoille) viimeistään 31. lokakuuta 2019. Muiden yliopistojen opiskelijoiden on valmistuttuaan viimeistään 31. lokakuuta 2019 Segreteria Studentissa.
Opetussuunnitelma
Aiheet
Università Degli Studi di Milano tarjoaa kursseja, jotka keskittyvät biologisiin aiheisiin, kun taas Politecnico di Milano tarjoaa laskennallisia kursseja.
1. vuosi
1. lukukausi
- Pakolliset kurssit: Orgaaninen kemia; Bioinformatiikka ja laskennallinen biologia
- Valinnaiset kurssit: Genetiikka, solu- ja molekyylibiologia; Biokemia; Ohjelmointi ja tietokannat; Tilastot
2. lukukausi
- Pakolliset kurssit: Genomiikka ja transkriptomiikka; Tieteellinen ohjelmointi; koneoppiminen; Biotilastot
2. vuosi
1. lukukausi
- Pakolliset kurssit: Advanced Genomics and Epigenomics; Rakennekemia; Järjestelmäbiologia ja verkkoanalyysi
- Valinnaiset kurssit: Poikkitieteellinen projekti; Genominen Big Data Management and Computing
Pääsymaksut
Rankingit
QS Rankings 2023 (kesäkuu 2022)
- 1. Italiassa
- Maailman 139
Ohjelman tulos
Osallistumalla BCG-tutkinnon kursseille opit:
- Genomin tiedon organisoituminen sekä molekyyli- ja soluprosessit geenin ilmentymisen ja sen säätelyn pohjalta.
- Geenien ja niiden toiminnan tutkimiseen käytetyt kokeelliset menetelmät eri mallilajeissa, sekä prokaryoottisissa että eukaryoottisissa.
- Nykyaikaisessa genomi- ja epigenomitutkimuksessa käytetyt tekniikat, kuten seuraavan sukupolven sekvensointiin perustuvat analyysit (genomi- ja eksomi-sekvensointi, RNA-sekvensointi, ChIP-Seq ja niin edelleen).
- Bioinformaattisen analyysin menetelmät ja protokollat funktionaalisissa genomiikan tutkimuksissa (genomi- ja eksomisekvensointi, RNA-sekvensointi, ChIP-Seq ja niin edelleen).
- Bioinformatiikan ja genomianalyysityökalujen taustalla olevat algoritmiset, matemaattiset ja tilastolliset lähestymistavat.
- Tietokantateknologiat tietojen tallentamiseen ja järjestämiseen.
- Järjestelmäbiologiassa käytetyt mallinnus- ja analyysitekniikat vuorovaikutusten tutkimiseen monimutkaisissa biologisissa järjestelmissä.
Ohjelma sisältää perustavanlaatuisena askeleena opiskelijoiden muodostuksessa harjoittelun tutkimuslaboratorioissa joko Milanon yliopistossa, Politecnicossa tai muissa italialaisissa tai ulkomaisissa tutkimuslaitoksissa. Harjoittelun tutkimuskokemus ja sen tulokset kuvataan kirjallisessa loppuväitöskirjassa, joka käsitellään opinnäytetyötoimikunnan edessä.
Uramahdollisuudet
BCG:n maisterintutkinnon tavoitteena on kouluttaa "tietotieteilijöitä", korkeasti koulutettuja ammattilaisia, jotka pystyvät yhdistämään syvällisen tietämyksen biotieteiden molekyyliperustasta ajan tasalla olevien bioinformatiikan ja genomianalyysin tekniikoiden ja teknologioiden kanssa. Erityisesti painotetaan määrällisiä ja laskennallisia näkökohtia myöhemmissä, jotka keskittyvät biologisten järjestelmien analysointiin, mallintamiseen ja ymmärtämiseen. Lopullisena tavoitteena on kouluttaa monialaisessa kontekstissa ammattilaisia, jotka ovat valmiita selviytymään modernin biomolekyylitieteen haasteista postgenomisen aikakaudella ja jotka kykenevät yhdistämään ja integroimaan tietoa biologiasta, genetiikasta, tietojenkäsittelytieteestä, tietotekniikasta ja perustutkimuksen tai soveltavan tutkimuksen eri alojen tilastot.
BCG:stä valmistuneet voivat siten:
- Osallistu laajamittaisten genomianalyysien suunnitteluun ja toteuttamiseen.
- Tunnista ja poimi biologinen merkitys saaduista tuloksista.
- Suunnittele työkaluja ja protokollia erityyppisten kokeellisten tietojen bioinformaattiseen analysointiin itsenäisesti.
- Keskeinen rooli perus- tai soveltavaan genomitutkimukseen keskittyneissä tutkimusryhmissä.
- Koordinoi ja ohjaa bioinformatiikkaan ja genomiikkaan keskittyviä tutkimusprojekteja ja ryhmiä.