On olemassa useita yksityisiä yliopistoja että löytyy koko Guatemala. Tästä huolimatta on vielä joitakin alin lukutaidon tasoa kaikissa Keski-Amerikan. Niille, jotka haluavat opiskella tässä maassa voi joutua maksamaan korkeampia lukukausimaksuja vuoksi yksityistetty koulujärjestelmiä.

Luonnontieteiden maisterin tutkinto (MSc eli Master of Science) on kansainvälisesti tunnustettu tutkinto, joka osoittaa, että sen haltija on oman alansa pätevä ammattilainen. Suurimman osan luonnontieteiden maisterin tutkinnoista voi suorittaa neljässä vuodessa. Tämän jälkeen voi suunnata joko suoraan työmarkkinoille tai jatkaa opintojaan edelleen.