On paljon laitosten korkeakoulutuksen kaikkialla Kirgisiassa. Tämä sisältää noin kolmekymmentä seitsemän julkisia yliopistoja ja kahdeksantoista yksityisiä yliopistoja. Keskeiset yliopistojen Kirgisia kuuluu University Keski-Aasian ja Kirgisian kansallinen yliopisto.

Maisterin tutkinnon saaminen vaatii perustutkintojen hyväksyttävää suorittamista. Maisterin tutkinto myönnetään yleensä 12 - 18 collegekurssin jälkeen, ja opintoihin sisältyy yleensä myös kattavia tenttejä ja/tai pro gradu -työ.